مرکز تحقیقات سلامت باروری و جمعیت با هدف و رسالت نیازسنجی منطقه ای و ارج نهادن به تلاش ها، ایده های نو، همکاری های تخصصی و بین بخشی درون سازمانی و برون سازمانی و حمایت پژوهشگران در راستای تولید علم، فناوری و توانمندسازی جامعه در سطح ملی و بین المللی برای ارتقاء سطح سلامت باروری و جمعیت است. اهداف این مرکز ، شامل موارد زیر است:
نیاز سنجی از ذینفعان و تعیین اولویت های پژوهش در زمینه سلامت باروری و جمعیت در سطح شهرستان، منطقه و کشور
انجام پژوهشهای بنیادی اپیدمیولوژیک و بالینی در جهت اصلاح نظام ارائه خدمات بهداشتی درمانی کشور به منظور جوابگویی به نیازهای جامعه اسلامی
توسعه و به کارگیری دانش و پژوهش بشری در زمینه ی سلامت باروری و جمعیت
شناخت و تقویت انگیزه های تحقیقاتی در زمینه ی سلامت باروری و جمعیت
معرفی زمینه های کاربرد نتایج تحقیقات سلامت باروری و جمعیت
پیشنهاد خط مشی و سیاست های توسعه پژوهش در سلامت باروری و جمعیت
کمک به تدوین استانداردهای ملی و ضوابط ارزشیابی در زمینه های سلامت باروری و جمعیت
طراحی و تدوین بانک اطلاعاتی تخصصی در زمینه های سلامت باروری و جمعیت
مشارکت در راه اندازی همایش و کارگاهها و ارائه دستاوردهای سلامت باروری و جمعیت
تربیت و توانمندسازی نیروی انسانی پژوهشگر در زمینه سلامت باروری و جمعیت
ترغیب، تشویق و به کارگیری محققین در زمینه سلامت باروری و جمعیت
تقویت پژوهش های کاربردی درون مرزی و برون مرزی در زمینه ی سلامت باروری و جمعیت
تقویت پژوهش های بین رشته ای خارج از وزارت بهداشت
توافق با ذینفعان در مورد اولویت های پژوهشی و سوق دادن فعالیت های پژوهشی مرکز در این جهت
جذب منابع ملی و خارجی اعم از مالی و انسانی
سازماندهی تشکیلات و فرایندهای مرکز تحقیقات
انتشار مقالات و کتب در زمینه های سلامت باروری و جمعیت
ارائه خدمات تخصصی به سازمانها، پژوهشگران، افراد جامعه و مراکز دولتی و غیر دولتی
استفاده بهینه از نتایج حاصل از طرحهای تحقیقاتی در راستای حل معضلات باروری و جمعیت در سطح شهرستان، منطقه و کشور
کوشش در جلب توجه و همکاری مراکز تحقیقاتی و اجرایی مربوطخ در داخل کشور
همکاری علمی با مراکز تحقیقاتی و آموزشی سایر کشورها و سازمانهای بین المللی با رعایت قوانین و مقررات دولت جمهوری اسلامی ایران